W 1939 r. wysiedlony przez okupanta niemieckiego z Dąbia nad Nerem (pow. Koło) osiadł wraz z rodziną w Gorlicach. W związku z działalnością konspiracyjną uruchomił zakład fotograficzny. W 1944 r. został aresztowany przez Gestapo i po pewnym czasie rozstrzelany. Zwłoki zakopano w zbiorowej mogile nad rzeką Ropą. Grób ekshumowano w marcu 1945 i szczątki ofiar przeniesiono do mogiły na cmentarzu parafialnym w Gorlicach. Ciało Marcina Bąkiewicza zostało wówczas rozpoznane. Później mogiłę ekshumowano, a szczątki przeniesiono na założony w Glinniku Mariampolskim (obecnie cz. Gorlic) cmentarz wojenny.